Cena CNG závisí především na ceně samotného zemního plynu, výši spotřební daně, kurzu koruny, distribučních poplatcích nebo nákladech na čerpací stanici. Přestože je cena zemního plynu také ovlivněna vývojem na burzách, podléhá menším vlivům než ropa, která se používá k výrobě benzínu a nafty.
„Důvodem, proč je cena zemního plynu na burze většinou stabilnější, je zejména rozdílný původ této komodity. Zemní plyn pochází hlavně ze Severního moře a Ruska, ropa ze středního východu," vysvětluje Jiří Lachout, odborník na CNG ze společnosti E.ON Energie.
V České republice je zatím cena CNG zatížena jen minimální spotřební daní. Z původních 0 Kč vzrostla tato daň na aktuálních 0,36 Kč/m3 , oproti tomu u nafty činí na jednom litru paliva 10,90 Kč, u benzínu 12,84 Kč. Do roku 2020 potom výše spotřební daně za plyn dosáhne 2,80 Kč/m3.
V roce 2015 dojde u CNG k lehkému zdražení. „V ceně CNG by se mělo promítnout zvýšení daně ze zemního plynu pro pohon motorů, a to o desítky haléřů na m3,“ dodává Lachout. Cenu CNG ovlivňují také poplatky za distribuci zemního plynu, které stanovuje Energetický regulační úřad.
Podle statistik serveru CNGplus.cz je aktuální cenový průměr u tohoto paliva 26,09 Kč za kilogram, na hlavních tazích je cena až o korunu vyšší. „Odhadujeme, že v příštím roce se bude cena pohybovat mezi 26,90-27,50 Kč. Menší stanice zvednou ceny k 26,50-26,90 Kč, dražší možná ještě výš, až k 27,50 Kč,“ myslí si Zdeněk Prokopec ze serveru CNGplus.